Siwikiでは、コンテンツの表示用のスクリプトをindex.php、編集その他の管理するスクリプトをadmin.phpとして分離しています。そのため、任意のサイトからの編集作業を簡単に制限することができます。また、admin.phpについては、Siwikiのユーザ管理で管理者及び登録されたユーザのみ実行できるようにしておりますので、より安全に編集等を行うことができるようになっております。